Transgenders hebben op allerlei gebieden met discriminatie te maken. Transgenders ervaren vooral discriminatie op de arbeidsmarkt en in de openbare ruimte.
In Nederland zet de stichting Transgender Netwerk Nederland (www.transgendernetwerk.nl) zich landelijk in voor de emancipatie van transgender personen en hun omgeving. Bestrijding van discriminatie van transgender personen is één van hun speerpunten.